Istotnym źródłem pośredniego finansowania działalności organizacji pozarządowych są również różnego rodzaju zwolnienia podatkowe. Zasadnicze znaczenie będzie tu miał podatek dochodowy od osób prawnych. Organizacje pozarządowe, jako podatnicy prowadzący działalność statutową, co do zasady, podlegają zwolnieniu przedmiotowemu od tego podatku, oczywiście po spełnieniu wymaganych przepisami warunków. Przy czym zwolnienia przewidziano także w innych podatkach.